Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nme8Q715T0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nme8Q715T0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nme8Q715T0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nme8Q715T0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms