Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg5Q6ZPY2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg5Q6ZPY2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms