Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl3Q6W5C0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cxcl3Q6W5C0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl3Q6W5C0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms