Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd300lfQ6SJQ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd300lfQ6SJQ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd300lfQ6SJQ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd300lfQ6SJQ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd300lfQ6SJQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms