Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R3

Crip3, Cysteine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip3Q6Q6R3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crip3Q6Q6R3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Crip3Q6Q6R3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crip3Q6Q6R3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms