Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1cQ6PDZ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1cQ6PDZ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1cQ6PDZ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1cQ6PDZ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms