Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1F6

Ppp2r2a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2aQ6P1F6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppp2r2aQ6P1F6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2r2aQ6P1F6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms