Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
U2surpQ6NV83 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2surpQ6NV83 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms