Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg16l2Q6KAU8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg16l2Q6KAU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l2Q6KAU8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms