Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn11Q6J756 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn11Q6J756 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn11Q6J756 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn11Q6J756 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn11Q6J756 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn11Q6J756 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn11Q6J756 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn11Q6J756 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms