Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arhgap20Q6IFT4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Arhgap20Q6IFT4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arhgap20Q6IFT4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms