Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ScapQ6GQT6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ScapQ6GQT6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ScapQ6GQT6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ScapQ6GQT6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms