Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11bQ6DFW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp11bQ6DFW5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp11bQ6DFW5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp11bQ6DFW5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms