Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nop58Q6DFW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nop58Q6DFW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Nop58Q6DFW4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nop58Q6DFW4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nop58Q6DFW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms