Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fndc3c1Q6DFV6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fndc3c1Q6DFV6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fndc3c1Q6DFV6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fndc3c1Q6DFV6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms