Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn1Q6A0D4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn1Q6A0D4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rftn1Q6A0D4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn1Q6A0D4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms