Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swap70Q6A028 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swap70Q6A028 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Swap70Q6A028 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swap70Q6A028 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms