Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pds5aQ6A026 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pds5aQ6A026 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pds5aQ6A026 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms