Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ino80dQ66JY2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Ino80dQ66JY2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ino80dQ66JY2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80dQ66JY2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms