Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VclQ64727 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VclQ64727 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VclQ64727 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VclQ64727 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VclQ64727 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VclQ64727 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VclQ64727 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VclQ64727 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VclQ64727 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VclQ64727 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VclQ64727 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VclQ64727 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VclQ64727 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VclQ64727 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VclQ64727 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VclQ64727 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VclQ64727 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VclQ64727 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VclQ64727 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VclQ64727 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VclQ64727 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VclQ64727 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VclQ64727 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VclQ64727 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VclQ64727 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VclQ64727 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VclQ64727 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VclQ64727 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VclQ64727 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VclQ64727 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VclQ64727 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VclQ64727 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VclQ64727 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VclQ64727 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VclQ64727 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VclQ64727 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VclQ64727 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VclQ64727 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VclQ64727 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VclQ64727 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VclQ64727 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VclQ64727 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VclQ64727 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VclQ64727 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VclQ64727 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VclQ64727 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VclQ64727 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VclQ64727 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VclQ64727 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VclQ64727 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VclQ64727 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VclQ64727 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VclQ64727 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms