Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Aebp1Q640N1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Aebp1Q640N1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Aebp1Q640N1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Aebp1Q640N1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Aebp1Q640N1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Aebp1Q640N1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms