Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Supt6hQ62383 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Supt6hQ62383 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Supt6hQ62383 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Supt6hQ62383 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Supt6hQ62383 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Supt6hQ62383 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms