Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RhocQ62159 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhocQ62159 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RhocQ62159 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhocQ62159 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhocQ62159 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhocQ62159 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhocQ62159 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhocQ62159 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RhocQ62159 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RhocQ62159 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RhocQ62159 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms