Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rai1Q61818 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rai1Q61818 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai1Q61818 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai1Q61818 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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