Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim25Q61510 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim25Q61510 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms