Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cntn2Q61330 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn2Q61330 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn2Q61330 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn2Q61330 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms