Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp4Q61107 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp4Q61107 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp4Q61107 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms