Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Tnfrsf8Q60846 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnfrsf8Q60846 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms