Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SkiQ60698 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SkiQ60698 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SkiQ60698 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SkiQ60698 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SkiQ60698 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SkiQ60698 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 608.3 ms