Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sin3aQ60520 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sin3aQ60520 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sin3aQ60520 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sin3aQ60520 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sin3aQ60520 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms