Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Specc1Q5SXY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Specc1Q5SXY1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Specc1Q5SXY1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Specc1Q5SXY1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Specc1Q5SXY1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms