Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Myh1Q5SX40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myh1Q5SX40 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh1Q5SX40 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myh1Q5SX40 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms