Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9930111J21Rik1Q5SVP0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms