Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Bbs12Q5SUD9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bbs12Q5SUD9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bbs12Q5SUD9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms