Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc85aQ5SP85 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85aQ5SP85 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85aQ5SP85 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms