Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rapgef6Q5NCJ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rapgef6Q5NCJ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rapgef6Q5NCJ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rapgef6Q5NCJ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms