Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Trim41Q5NCC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Trim41Q5NCC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Trim41Q5NCC3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Trim41Q5NCC3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Trim41Q5NCC3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Trim41Q5NCC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms