Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
1810065E05RikQ5NC41 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1810065E05RikQ5NC41 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
1810065E05RikQ5NC41 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1810065E05RikQ5NC41 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1810065E05RikQ5NC41 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms