Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm3Q5F4S9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Trpm3Q5F4S9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trpm3Q5F4S9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm3Q5F4S9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm3Q5F4S9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms