Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prkaa1Q5EG47 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkaa1Q5EG47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkaa1Q5EG47 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms