Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ndufaf2Q59J78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndufaf2Q59J78 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms