Protein–RNA interactions for Protein: Q52KP5

Nxpe4, NXPE family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe4Q52KP5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe4Q52KP5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nxpe4Q52KP5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxpe4Q52KP5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms