Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhox3aQ4TU90 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rhox3aQ4TU90 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox3aQ4TU90 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms