Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc43Q3V0L5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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Lrrc43Q3V0L5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc43Q3V0L5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc43Q3V0L5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
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