Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hipk4Q3V016 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk4Q3V016 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk4Q3V016 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms