Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnaaf3Q3UYV8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Dnaaf3Q3UYV8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms