Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C87499Q3UX49 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C87499Q3UX49 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C87499Q3UX49 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms