Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn13Q3UW68 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capn13Q3UW68 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms