Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SfswapQ3USH5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SfswapQ3USH5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SfswapQ3USH5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms