Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Znf48Q3US17 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf48Q3US17 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf48Q3US17 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms